Windows 10 1703 (и выше) позволяет корректно работать с USB флешками/SD картами с несколькими разделами. В предыдущих версиях Windows отображался только первый основной раздел.
http://winitpro.ru/index.php/2017/04/28/sozdaem-neskolko-razdelov-na-usb-fleshke-v-windows-10/
http://winitpro.ru/index.php/2017/04/28/sozdaem-neskolko-razdelov-na-usb-fleshke-v-windows-10/