Можно при проверке пропустить объекты подсистемы, но проверить какой-нибудь конкретный объект этой подсистемы. Для этого необходимо в комментарии подсистемы написать: "АПК:566-выкл не проверяем синхронные вызовы". А в комментарии к объекту оставить запись: "АПК:566-вкл проверяем синхронные вызовы.".