🚀 @SBERLOGABIO webinar on bioinformatics:
👨🔬 Егор Марин "Структурная статья в post-Alphafold эпоху, или структурные основы обратного агонизма S1P5-рецептора"
⌚️ Friday 16 September, 17.00 (Moscow Time)
❗️Обратите внимание - время раньше обычного
У нас 12 августа вышла долгожданная статья в Nature Communications , в которой мы определили структуру sphingosine-1-phosphate receptor 5 (S1P5R) с селективным обратным агонистом, и внимательно на неё посмотрели.
В докладе я расскажу то, что я в работе считаю самым интересным. Будет как специфичная для конкретного белка информация, так и общие факты. А именно:
- чем необычна и интересна конформация белка, которую мы получили
- как мы показывали, что она не встречается в других белках этого семейства
- почему наша структура сильно лучше того что выдаёт Alphafold
- как использовать Google Patents в научной работе
- и в целом как выглядит "мы решили структуру" работа в пост-Alphafold эпоху
Не будет в докладе, но могу рассказать в свободном режиме после презентации:
- как нам почти что помогло компьютерное зрение в обработке кристаллографических данных
- про историю разрешения кристаллического дефекта при помощи ревьюера
- и в целом общие вопросы по тегам.
Теги: GPCR, S1PR, Alphafold, структурная биология, кристаллография,
📹 Video: https://youtu.be/aU6tdqyiapg
📖 Presentation: https://t.me/sberlogabio/39947
👨🔬 Егор Марин "Структурная статья в post-Alphafold эпоху, или структурные основы обратного агонизма S1P5-рецептора"
⌚️ Friday 16 September, 17.00 (Moscow Time)
❗️Обратите внимание - время раньше обычного
У нас 12 августа вышла долгожданная статья в Nature Communications , в которой мы определили структуру sphingosine-1-phosphate receptor 5 (S1P5R) с селективным обратным агонистом, и внимательно на неё посмотрели.
В докладе я расскажу то, что я в работе считаю самым интересным. Будет как специфичная для конкретного белка информация, так и общие факты. А именно:
- чем необычна и интересна конформация белка, которую мы получили
- как мы показывали, что она не встречается в других белках этого семейства
- почему наша структура сильно лучше того что выдаёт Alphafold
- как использовать Google Patents в научной работе
- и в целом как выглядит "мы решили структуру" работа в пост-Alphafold эпоху
Не будет в докладе, но могу рассказать в свободном режиме после презентации:
- как нам почти что помогло компьютерное зрение в обработке кристаллографических данных
- про историю разрешения кристаллического дефекта при помощи ревьюера
- и в целом общие вопросы по тегам.
Теги: GPCR, S1PR, Alphafold, структурная биология, кристаллография,
📹 Video: https://youtu.be/aU6tdqyiapg
📖 Presentation: https://t.me/sberlogabio/39947