Пользователь root - пользователь с максимальными правами, имеет:



Право на изменение любого файла - root может читать, записывать, удалять любые файлы, в том числе и файлы в домашних каталогах других пользователей.



Право на изменение конфигурации системы - пользователь root может изменять конфигурацию систему посредством редактирования файлов в каталоге /etc, /proc, запуска конфигураторов системы.



Право на запуск любых программ - root может запустить любую программу, в каком бы каталоге она ни находилась.



Право на создание, удаление, изменение (в том числе изменение пароля) других учетных записей.



Право на установку и удаление программ.



Как вы понимаете, власть пользователя root неограниченна. Так было до определенного момента, пока не появились системы принудительного контроля доступа, которые могут ограничить даже самого root. Вот только беда SELinux, LIDS, Tomoyo и другие подобные системы по умолчанию неактивны или даже не установлены, поэтому пока их не активировать пользователь root будет все равно самым главным.